Exemples de voies de signalisation (4h) Cette unité d’enseignement vise à mettre en application les outils informatiques et statistiques indispensables aux analyses de données massives (big data en biologie). The student will carry out an investigation through bibliographic research and interaction with the host team on the research subject that he/she will conduct during his/her M2 internship. The Scientific Project is a groundwork for the laboratory internship. Acquisition progressive des compétences. -Functional full-term placentas formed from parthenogenetic embryos using serial nuclear transfer. Au cours de la première partie, les éléments génétiques impliqués dans la Dynamique des Génomes, ainsi que les fonctions biologiques associées, seront définies. - plateforme Physiologie et Physiopathologie : Géraldine Schlecht-Louf geraldine.schlecht-louf@universite-paris-saclay.fr, Karim Bénihoud karim.benihoud@universite-paris-saclay.fr Students will be able to: Neurosciences, M. F. Bear-B. -Comparer deux structures par superposition - de décrire et évaluer la diversité génétique à différentes échelles, -Comparer ses résultats expérimentaux avec les données de la littérature scientifique -Interpret results of large-scale experimental datasets in a scientifically stringent manner Les méthodes simples pour analyser les masses et l’hétérogénéité des données expérimentales obtenues, leur reproductibilité sera vue dans l’UE « Analyse et valorisation des données omics ». Les revues utilisées peuvent changer d'une année à l'autre. Etre titulaire du Diplôme national de Licence en Sciences de la vie, obtenu avant le 1er septembre de l'année universitaire pour laquelle vous candidatez. Programme : Microbiologie des sols; Microbiologie Générale; ... Pour lier recherche fondamentale et appliquée en écologie, il faut donc poser des questions innovatrices pouvant apporter des réponses aux questions urgentes posées par la pratique. Animal Transgenesis, Title of educational component in English : DS Falster and M Westoby; TRENDS in Ecology and. (c) appréhender une situation de laboratoire et disposer de solides compétences pratiques (maîtrise de l’usage d’équipements et de protocoles, autonomie, rigueur) Biochimie et biophysique des membranes Shechter (2000) Dunod. -Student personal work Nous montrons l’omniprésence et la diversité des parasites dans différents hôtes (rongeurs, poissons, grenouilles, blattes), en III. • Introduction à la microbiologie - Etre familiarisé avec l’anglais scientifique. Réparation de type NER -Modéliser les systèmes étudiés à l’aide de traitements mathématiques Décrire certaines des méthodologies multi-échelle utilisées en Neurosciences : des aspects comportementaux jusqu’à l’analyse cellulaire et moléculaire. Cet UE est organisée sous forme de cours et de TP permettant d'illustrer les différents aspects du cours. 630, université Paris Sud/Paris Saclay, Orsay). Biochimie du métabolisme. The backing of this teaching unit to laboratories and themes of Paris-Saclay Research Institutes will allow students to learn the latest techniques and to interact with researchers. Pr. - Partiel de 2nde session sous forme d'un examen écrit (EE) et/ou oral (EO). Précis de Génomique. Scientific articles and review on recent concepts and advances in Applied genomics. 2015 Dec;39(4):259-66. -Utiliser un spectrophotomètre dans différents modes d’acquisition - Expliquer plusieurs mécanismes épigénétiques du contrôle de l'expression génique agissant au niveau de la chromatine, des ARN non codants, de la conformation 3D des chromosomes et des protéines prions. It aims at clarifying the general scientific context and the state of knowledge. En parallèle des expérimentations, les étudiants devront rédiger un rapport de TP à la manière « d’un cahier de laboratoire ». 1 intervenant CEA. Dr Bouligand Jérôme, Dr Degerny Cindy; Dr Bonnin Rémy, Dr Géraldine Schlecht-Louf. Biochimie et Biophysique des membranes, E. Shechter, Ed. Microbiologie : Structures cellulaires et fonctions chez les microorganismes, Microbiologie Générale. Sizing concept and modeling of biological treatment processes; L’Unité d’enseignement est divisée en deux parties ; la première, intitulée Mécanismes de la Différentiation et de la Prolifération Cellulaire, comprend l’enseignement des facteurs de croissance et leur récepteurs, des voies de transduction des signaux cellulaires depuis la surface cellulaire jusqu’aux gènes, des facteurs de transcription, de la transcription des gènes et ses régulations, du cycle de division cellulaire, des régulations du tandem prolifération/différenciation, des molécules d’adhérence cellulaire, des cytokines et leurs récepteurs, ainsi que les cellules souches. - 2nde session: F = EE et/ou EO. Une séance de TP consacrée au séquençage nouvelle génération de l'ADN est organisée en partenariat avec la société Illumina. -Analyser des résultats expérimentaux obtenus en TP Aucun pré-requis en bioinformatique, Bonnes connaissances de biologie cellulaire et biologie moléculaire. Plan : -Elaborer un protocole de clonage de fusion de gènes en utilisant un logiciel de biologie moléculaire. Branton D, Deamer DW, Marziali A, Bayley H, Benner SA, Butler T, Di Ventra M, Garaj S, Hibbs A, Huang X, et al. -Réaliser les démarches pour trouver un stage en laboratoire de recherche. -First R script to solve the project - exprimer leurs idées en utilisant le lexique, la prononciation et l’intonation appropriés ; Le stage expérimental dure 4 semaines au moins, au cours desquelles l’étudiant réalise une série d’expériences pour répondre à une question scientifique précise et définie. Introduction à la démarche Qualité, aux normes et à la réglementation en vigueur dans les entreprises agro-alimentaires et pharmaceutiques. maladies à amplification de triplets Pendant ce stage, l’étudiant(e), encadré(e) par un chercheur qui aura préalablement participé à la définition du sujet du stage, aura à mettre en œuvre des expériences dans le but de répondre à la problématique scientifique, à les analyser avec un esprit critique puis à les mettre en forme pour les restituer de manière claire. Compétences complémentaires acquises par l’étudiant durant cette UE : Interface biologie-chimie, recherche bibliographique, présentation à l’oral. Sylvie Nessler, Pr, UPSay Education. Les cours s’appuient également sur des articles scientifiques originaux. -Identifier les méthodes d’analyses génétiques à mettre en oeuvre selon une problématique Semaine 4 A physiologist's view of homeostasis. R Génétique fondamentale et appliquée 1 r Microbiologie matirial pdf générale et alimentaire 1.il y a 6jours. Introduction à l'Imagerie médicale: Applications cliniques et pré-cliniques (CM) •Medical Physiology, Boron et Boulpaep 6. Ce parcours s'adresse aux étudiants ayant validé niveau M1 des compétences en génétique et biologie moléculaire, et des connaissances théoriques et/ou expérimentales dans le domaine de la Microbiologie. Ludwig Jardillier Vincent ROBERT, INSERM - Gasch AP et al., Mol. Seminars on the activities carried out at the IRSTEA (National Institute for Research in Science and Technology for the Environment and Agriculture). Articles de revue scientifiques récents expliquant les fondamentaux et les avancées scientifiques de la régulation de l’expression génique par les ARNs non codants. Oral presentations of scientific research will be held by the students in a seminar format during the course. Michel Arock (PU, ENS Paris Saclay), Guillaume Barthole (PRAG, ENS Paris Saclay), Karim Benihoud (PU, Université Paris-Saclay), Pierre Bobé (PU, Université Paris-Saclay), Emilie Guillaume (PRAG, ENS Paris Saclay), Pascale Rialland (PRAG, ENS Paris Saclay), Clémence Richetta (MCU, ENS Paris Saclay). Cécile GASSE Cécile, MCF, UEVE RX: Bases méthodologiques et Applications (CM). 4-Analyser des résultats scientifiques OAV2. Juan Pelta, Pr en Biochimie et biologie moléculaire, LAMBE, co-directeur du DIM Respore - Analyses d'articles scientifiques portant sur les sujets développés en CM. 5. P. M. Visscher, N. R. Wray, Q. Zhang, P. Sklar, M. I. McCarthy, M. A. Les cours aborderont la question des risques pour la santé (risques microbiologique, allergique, nutritionnel) associés aux modes de production/consommation alimentaires, sous l’angle biologique (microbiologie, physiologie, biologie cellulaire et moléculaire). - Identify the appropriate methodology (genetic tools & technics) required for studying developmental processes at different scales and in various model organisms. Savoir Illustrer et expliquer les méthodes de base pour l’étude des protéines Parmi les matières traitées lors des cours : la gestion de la forte lumière ; le stress oxydant ; les mécanismes de défense contre les xénobiotiques (métaux lourds, herbicides) ; les grandes voies du métabolisme secondaire. Modélisation par des lois usuelles -Identifier et justifier les niveaux de risques et de confinements adaptés aux agents biologiques manipulés. -Biologie moléculaire -Décrire la structure et caractériser les propriétés électrophysiologiques/pharmacologiques des récepteurs de type AMPA et NMDA. This course is intended for all students in Biology, regardless their master’s speciality, as well as for students who are at the interface between Biology and other disciplines such as Physics, Chemistry, Mathematics, Physics and Computer Sciences. d) d'analyser, interpréter et décrire les résultats présentés dans des articles scientifiques, Plan des enseignements : Ces séances seront animées par les conférenciers invités, chercheurs en virologie dans le périmètre de Paris-Saclay et de l’Ile de France. Thérapie cellulaire: 4/ l’influence de la nutrition sur le système immunitaire et le risque de cancer This 5 ECTS version is constituted of two one-week internships, each in a different lab on a different organism. L'étudiant doit avoir en particulier les connaissances de base dans les domaines suivants : L’acquisition de certains organites par des micro-organismes est un phénomène qui se produit encore à l’heure actuelle mais pour lequel l’organite est voué a priori à être temporaire. (2) Analyze and interpret epigenetic and epigenomic data from research articles and reviews Les données quantitatives récoltées devront être analysées par des traitements graphiques. - Elaborer une synthèse écrite pertinente sur ces connaissances Les lipides dans le monde vivant écrit par Claude LERAY Les cours auront lieu à la Faculté de Médecine (Kremlin-Bicêtre). A l’issue de cet enseignement, les étudiants seront capables : -Vieillissement et stress oxydant Alia Dellagi, Pr AgroParisTech The modalities of biofilm formation will also be presented. 5-Elaborer une démarche expérimentale visant à répondre à une question biologique ayant trait au développement. L.-A. maquette) ou d’une virtualisation (e.g. Organize and lead discussions on research projects written and orally presented by peers. 2019. Scientific project, Tous droits réservés Université Paris-Saclay, UEs obligatoire(s) - Tronc commun - 24 crédits ECTS, Stéphanie Bury-Moné (PU), Olga Soutourina (PU) Stéphanie Bury-Moné (PU), Olga Soutourina (PU), Confalonieri / Bury-Moné Fabrice / Stéphanie, Lagaudrière-Gesbert , Sitterlin Cécile, Delphine, UEs obligatoire(s) - Stage en laboratoire / Lab training - 30 crédits ECTS, Candidature et inscription en premier cycle, Internationalisation : Langues et Cultures, Textes statutaires et actes réglementaires, Tests gratuits tous les jours, résultats en 30 minutes, Practical course of integrative microbiology, Interactions microbiennes / Microbial Interactions, Initiation to data manipulation with R software, Cellular innovations and synthetic microbiology concepts, Virologie moléculaire et cellulaire - UPSay, Microbial Ecology of Fermented Food Products, Medico-pharmaceutical applications of microbial biodiversity, Introduction à la statistique avec R (MOOC), https://mooc-francophone.com/cours/mooc-introduction-statistique-r/, Environmental and Microbial Biotechnologies, ARN non-codants et épigénétique / ncRNA and Epigenetics, https://www.college-de-france.fr/site/en-edith-heard/_course.htm, https://www.universite-paris-saclay.fr/admission/etre-candidat-nos-formations-master, stephanie.bury-mone@universite-paris-saclay.fr. Sébastien Bloyer, sebastien.bloyer@universite-paris-saclay.fr En couleur et très illustré, cette introduction à la microbiologie s'articule en trois parties. Systems Biology is an approach where omics data are integrated and exploited (compared) through mathematical models of biological systems or sub-systems. Elle comporte également une partie pratique sur l'étude de la mort cellulaire induite par un agent anticancéreux. L'enseignement proposé vise à apporter une formation théorique et pratique en virologie fondamentale et appliquée. - The mechanisms of membrane fusion/fission in relation with exocytosis/endocytosis in the context of patho-physiological processes (synapse; entry/exit of a virus) Key words Pour les étudiants internationaux francophones: Etre titulaire d'un diplôme équivalent à la licence de Sciences de la vie, garantissant les mêmes pré-requis, obtenu avant le 1er septembre de l'année universitaire pour laquelle vous candidatez. Micaela Galante, MCU Evaluation Cette UE est composée majoritairement de travaux pratiques, elle se déroule sur 7 jours ouvrés pleins consécutifs. - Décrire l'immunothérapie ou la thérapie génique ou la thérapie cellulaire dans le cancer Définir et introduire les nanosciences, discuter les enjeux pour la biologie, la santé, les biotechnologies, tant au niveau fondamental que pour de futures applications. 2.Production de données génomiques en laboratoire (génotypage de SNPs et contrôles qualités) - Written exam on Course, tutorial sessions and seminar. Martine Thomas, MCF Université Paris Sud. Jean-René Martin, DR CNRS -Specify the advantages of single-cell approaches regarding the dynamic of transcriptome, tissue complexity or polyclonal sample content. 2004, 347p. M. Taouis Pr Bruno Colombo 4. Il est Lippincott Williams & Wilkins. -Vieillissement et santé publique : approche épidémiologique. Laurence MERY. Institut de biologie fondamentale et appliquée. A l’issue de leurs présentations, les étudiants doivent répondre à un appel d’offre de recherche (eg. Les enseignements de cette UE "massée" auront lieu au 1er semestre, lors de la semaine 51 (5 jours, matin et après-midi). - Contrôle continu (CC), lors des séances de TD La régulation de la différenciation et ses aspects pathologiques sont présentés dans le modèle de l’hématopoïèse. -demonstrate a good understanding of fundamental facts, concepts and challenges in prominent areas of LSH Dunod. The project will be evaluated on its originality, coherence/relevance, feasibility and state of the art in the scientific context chosen bu the students. Jean-René Martin (CNRS) -Savoir définir les termes de catalyse, enzyme, substrat, produit de réaction, cinétique, inhibiteur compétitif et non compétitif L’enseignement se partage entre cours magistraux et travaux dirigés sur une journée par semaine, pendant 8 semaines. - La réponse aux stress et la complexité des réseaux de régulations Edit. Ces exposés pourront, par exemple, porter sur l’application des VLP en laboratoire ; les méthodes d’imagerie des virus  ou de transfections... Au cours du premier semestre, les étudiants doivent trouver un laboratoire d'accueil. -Understand how to identify altered signaling pathways, biological process and biomarkers from genes list by functional annotation tools, (a) disposer d’une vision d’ensemble d’un éventail actualisé d’outils de biologie moléculaire et biochimie permettant : (i) d'exprimer une protéine recombinante en système procaryote en répondant à divers objectifs d’un cahier des charges (niveau d’expression, localisation, détection et purification) ; (ii) de la purifier par différentes techniques de chromatographie et de la caractériser B. Les approches en immunothérapie anticancéreuse Virus d’importance médicale: cancer, VIH. 1. Lesson plan: Un cahier de cahier de manipulations devra être rédigé tout au long du TP. enzymes ; spécificités de la catalyse enzymatique ; co-facteurs. Cours magistraux avec activités interactives pendant la séance (questions-réponses avec boîtiers) plus un control continu en début de séance (quizz ecampus sur le cours précédent). Ils prépareront toutes les solutions nécessaires à la réalisation des expériences. 2. - Développement des mécanismes de régulation par les ARNnc chez les animaux.
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